超高效液相系统耐压更高，可以以更高的流速进行分析，并且在高流速下仍能保持很好的理论塔板数。
高效指的就是效率更高，即在同样的时间内可以分析更多的样品。高效液相色谱是相对经典液相色谱来说的，高效液相色谱具有更细的流动相传输管路，内径更细的色谱柱，从而使死体积变小，理论塔板数更高，分析时间更短。超高效就是通过提高流速来减小出峰时间，缩短样品流出速度，从而提高单针的分析时间来实现比高效液相更加“高效"的。
超高效液相需要整个液相色谱系统，包括色谱柱都具有很高的耐压能力，故其所用的配件和色谱柱一般均为专用，不可用高效液相色谱柱代替。